Je pense que tu as pris le problème a l’envers. Normalement tu installes d’abord l’appli que tu veux sur ton profile principale et tu le clones vers shelter ensuite.
Dans ton cas j’ai l’impression que tu as installer WA via le App Lounge dans shelter. Ce doit être possible et ca doit sans doute fonctionner (je n’ai pas fait comme ca pour mes appli dans shelter).
Je te conseille de lire ce poste :
[HOWTO] Using WhatsApp under shelter
Encore mieux, je te conseille d’arrêter WA et de passer à signal, olvid ou telegram 
I think you have the problem backwards. Normally you first install the app you want on your main profile and then clone it to shelter.
In your case I think you installed WA via the App Lounge in shelter. This should be possible and it should probably work (I didn’t do this for my apps in shelter).
I advise you to read this post: